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人类的出现并没有引起妖界的重视，它们认为人类的寿命太短了，不足以与他们为敌。但令妖界没有没有想到的是人类的崛起十分的迅速，很快便对妖界产生了威胁。
这时妖类才重视起人类来，它们惊奇地发现，人类的灵智要远远高于妖类，虽然比不上麒麟与妖界四大护法，但却远远高于普通兽类。而且他们的寿命虽然比妖类要短，但他们的形体修行起来比妖兽更加方便。
最让妖族吃惊的是他们的修炼之法与妖族并不相同。人族可以通过转化天地的灵气来进行施法，而不需要自身修为的提高，人族将其称为“术”。这让妖界感到了威胁，于是群妖纷纷对抗起人类，阻止他们的繁衍。
人类虽然聪慧，但力量微薄。在妖王麒麟带领群妖的围攻下，很快便消亡了许多。眼看着人类被诛殆尽，他们的守护者女娲自然不能袖手旁观，她带领着人类奋起反抗，但在妖王麒麟面前依然有些势单力孤。
就在人类消亡殆尽之时，人类中出现了两个术法十分强大的人，他们便是伏羲与神农。神农与伏羲不但掌握了人族的术，并且他们发现了天地间的“道”。他们发现道虽然没有任何力量，但在道的辅助下，术变得无往不利。伏羲依靠着道发现了天地间的阴阳秩序，创立了八卦。神农则通过与天地间花草树木中灵类的交流悟道，获得了极尽不死的灵气。
最终，神农，伏羲与女娲三人联合起来，将入侵的众妖全数击败。妖族在最后关头一败涂地，最后不得不与人类画立界限，互不侵扰。
女娲，伏羲与神农的后人分为三个群族，三位领袖为他们的后人都留下了抵抗妖族的灵器。女娲为后人留下了女娲石，伏羲为后人留下了伏羲琴，而神农则留下了炼妖鼎。
又过了三百年后，女娲，伏羲与神农都已离世，但此时人类早已繁衍生息，逐步的吞噬着妖族的地界。
人类驱除了妖族后，三大族群却因为领地而发生了战争。女娲的后人九黎族生活于长江两岸，他们体内还存留着妖族的血脉。九黎族的首领蚩尤想要击败伏羲的后人黄帝与神农的后人炎帝，统一人类族群。他先向炎帝发起了进攻，炎帝抵抗不住实力强大的九黎族，向黄帝求援。于是黄帝与炎帝联合起来，与九黎族作战。九黎族抵挡不住黄帝与炎帝的联合进攻，于是有着妖族血脉的蚩尤向妖族求援。妖族因不断缩小的地盘而十分忌恨人族，于是妖王麒麟墨羽毫不犹豫便同意参战。
蚩尤手中有女娲石，而妖王墨羽手中则有锻造的妖界至宝血殁剑。如此一来，黄帝与炎帝便落了下风。就在炎黄部落快要战败之时，忽然黄帝想起了灵类。他向灵类献祭，希望灵类可以帮助他们打败蚩尤。灵类生性平和，不想参与黄帝与蚩尤的战争，但它们也不想要妖族再次占领天地间。于是灵类动用全族的灵气打造了一柄宝剑—紫龙剑。此剑乃是灵类至宝，它可以吸收和运用天地间灵气，可以号令地界所有灵类
灵类将这柄宝剑赠给了黄帝。由于此剑是灵类所铸造而成，所以一般的人族无法持有此剑，只能由人族中最亲近灵类的体质才能使用此剑。而在人族中黄帝的体质与灵类最为亲近，于是黄帝便亲佩此剑迎战蚩尤。
在紫龙剑的帮助下，黄帝与蚩尤的战争局势瞬间反转。黄帝又说服了妖界的黄龙一族加入人族。黄龙的灵智与青龙不相上下，但却因其血脉混杂而地位地下。于是它们欣然加入人族迎战群妖，黄龙一族的首领应龙更是成为了黄帝身边最为厉害的大将。
如此一来，蚩尤与妖族便是彻底落了下风，最后全部败给了黄帝。妖族再次撤回妖界，而九黎族人则臣服于黄帝，但九黎族人的首领蚩尤却在战败后不知所踪。
由于连年大战损耗了人族的实力，于是黄帝无心再寻找逃亡的蚩尤。他将人族全部整合了起来，称为炎黄部落，为了感谢应龙的帮助，黄帝将黄龙奉为人族的图腾。人族便开始兴旺了起来。